A helyzetet rontja, hogy a jogszabályokat a büntető igazságszolgáltatás szervei rendszerint nem alkalmazzák megfelelően a gyakorlatban. Ezért a Magyar Helsinki Bizottság rendőröknek, ügyészeknek, bíráknak szóló szakmai képzéseket szervez, amelyek elősegítik a gyűlölet-bűncselekmények hatékonyabb kivizsgálását, az elkövetők arányos büntetését és az áldozatok védelmét.
A Magyar Helsinki Bizottság tagja a Gyűlölet-bűncselekmények Elleni Munkacsoportnak (GYEM), amit 2012-ben öt magyarországi civil szervezet hozott létre. A GYEM célja gyűlölet-bűncselekményeket elutasító társadalmi közeg kialakítása, lobbizás megfelelő jogszabályokért, a hatékony jogalkalmazás támogatása, az áldozatok bátorítása, hogy indítsanak eljárást, ha bőrszínük, származásuk, vallásuk stb. miatt éri támadás őket. A munkacsoport tagszervezetei ingyenes jogi képviseletet nyújtanak a gyűlölet-bűncselekmények áldozatainak.
A GYEM munkája eredményeként módosították a Büntető Törvénykönyvet, bűncselekmények számos áldozata kapott jogi képviseletet, több mint száz rendőr részesült magas színvonalú képzésben, valamint számos szakanyagot készítettünk el a témában.